一、背景介绍药物靶标是药物发挥作用实现疗效的目标分子,是指具有重要生理或病理功能,能够与药物分子相结合并产生药理作用的生物大分子(包括基因位点、受体、酶、离子通道、核酸等)及其特有的结构域。
因此,药物靶标是药物筛选的基础,也是创新药物的前提,对新药创制具有源头创新意义。
天然产物是新药创制的重要来源,识别其作用靶点不仅为临床预防治疗提供可能新策略,也为进一步阐释中草药及其复方的作用特点及分子机制提供参考依据。
药物靶标发挥作用的机制大多是以蛋白质和其配体间的特定的相互作用为基础。
因此能够检测蛋白质复合物,并找到它们的相互作用模式,对于新药研发至关重要。
研究蛋白质之间及蛋白质与小分子之间的相互作用,常用的方法如X-ray单晶衍射和核磁共振,虽然能提供高分辨率的结构信息,但是耗时且需样量大。
质谱方法(MALDI-TOFMS、ESI-MS、MS-MS),灵敏度高分析速度快。
原理是在测定被标记的蛋白质大分子之前,一般采用位点特异性的蛋白酶对蛋白质进行酶解,然后对酶解形成的肽片段进行测定,找出被标记的蛋白质相互作用的结构位点。
但是质谱法分辨率不高,因此为了提高结构分析的分辨率,发展出重氢交换(HDX)、化学修饰、交联法以及快速印记法(羟基自由基或卡宾标记)等。
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