重编程因子的剂量效应对体细胞重编程的影响文献综述

 2023-02-11 09:02

开题报告内容：（包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述，不少于2000字）一、 拟研究或解决的问题目前，我们实验室发现了一种新的用七个转录因子（Jdp2、Nanog、Esrrb、Sall4、Kdm2b、Map2k6（Mkk6）、Glis 1）进行体细胞重编程的体系。

在对体系优化的过程中发现Glis1、Esrrb和Mkk6三个因子的病毒剂量会影响体细胞重编程效率，因此，希望深入研究这三个因子对体细胞重编程的影响，并找到最优剂量组合，进而揭示因子剂量效应背后的相关分子机制。

二、 研究手段1 根据三因素三水平试验进行正交试验或全面试验找到最优剂量组合。

在现有的七因子体细胞重编程体系中，以Glis1、Esrrb和Mkk6三种因子的剂量作为三个考察因素，在他们各自的最优剂量附近选取三个剂量水平，以此作为三因素三水平试验，按L9（34）正交表安排正交试验（共9组）或将全部排列组合方式（共27组）进行全面试验，检测不同剂量组合的重编程效率，确定最优剂量组合。

2 通过转录组测序技术（RNA-seq）比较最优剂量组与对照组在基因表达方面的差异，通过染色质开放性测序技术（ATAC-seq）比较两组在染色质结构状态方面的差异，尝试探讨剂量效应背后的机制。

三、 文献综述干细胞是一类具有自我更新和分化潜能的细胞。

在哺乳动物体内，干细胞可以分为胚胎干细胞（来自囊胚的内细胞团）和成体干细胞（来自其他组织，如：骨髓、血液、皮下脂肪组织等）。

根据其分化潜能的不同，干细胞又可以分为全能性（totipotent）干细胞、多能性（pluripotent）干细胞、专能性（multipoint）干细胞、寡能性（oligopotent）干细胞和单能（unipotent）干细胞。

其中，全能性干细胞可以分化成胚胎和胚外的细胞类型，可以形成一个完整的生命体，例如受精卵；多能性干细胞分化潜能稍弱，但也能分化成几乎所有的细胞类型，比如来自三个胚层的细胞。

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