摘 要：DNA甲基化作为一种重要的表观遗传学修饰方式，广泛存在于动物细胞和植物体中。
很多研究表明DNA甲基化不仅可以保护基因组免受外来插入序列的侵害，而且能起到调节基因表达的作用。
甲基化敏感扩增多态性法(MSAP)作为一种较新兴的DNA甲基化检测技术，近年来广泛应用于动植物基因组DNA甲基化研究中。
本文主要综述了DNA甲基化原理以及MSAP在机理、流程方面的研究进展。
关键字：DNA甲基化；MSAP；表观遗传学Progress in MSAP of Plant Genomic DNA MethylationLu RuihuaSchool of Pharmacy, Nanjing University of Chinese MedicineAbstract：DNA methylation is an important epigenetic modification that is widely found in animal cells and plants. Many studies have shown that DNA methylation not only protects the genome from foreign insertions, but also regulates gene expression. As a new DNA methylation detection technology, methylation-sensitive amplified polymorphism (MSAP) has been widely used in the research of animal and plant genomic DNA methylation in recent years. This paper mainly reviews the DNA methylation principle and the research progress of MSAP in mechanism and process.Keywords: DNA methylation; MSAP; Epigenetics引言表观遗传学（Epigenetics）是由Waddingtong在1942年首次提出[ ]，1990年Robin Holliday将表观遗传学重新定义，即研究在DNA序列没有发生改变的情况下，基因功能发生改变，产生可遗传表型的的现象[ ]。
表观遗传学的研究主要包含DNA甲基化 (DNA methylation)、组蛋白修饰(Histone modification)、非编码RNA(Non-coding RNA，ncRNA)、X染色体失活(X chromatin inactivation)、基因组印记(Genomic imprinting)、染色质重塑(Chromatin remodeling)等多种修饰方式，其中DNA甲基化作为早被研究和发现的表观遗传学修饰，其研究最为深入[ ]。
DNA甲基化是指真核生物把S-腺苷甲硫氨酸（S-adenosyl-methionine，SAM）等作为甲基供体，在DNA甲基转移酶（DNA methyltransferases,DNMTs）的作用下，将甲基(-CH3)转移到DNA分子中的特定碱基上，其中最常见的特定碱基是5-甲基胞嘧啶（5-mC）[ ]。
在植物体中，DNA甲基化不仅可以保护基因组免受外来插入序列的侵害，而且调节基因表达[ ]。
根据研究目的不同，DNA甲基化检测技术可分为两组。
第一组主要集中于基因组整体甲基化水平检测，通过甲基化敏感扩增多态性法(Methylation-sensitive amplified polymorphism，MSAP；又称Methylation sensitive AFLP，MS-AFLP)、高效液相色谱(High performance liquid chromatography,HPLC)、液相色谱-串联质谱（Liquid chromatograph tandem mass spectrometry，LC-MS/MS）和双抗夹心酶联免疫吸附测定(Enzyme-linked immuno sorbent assay, ELISA)等方法，测定基因组中5-mC的含总量；第二组主要集中于特定位点甲基化检测，通过亚硫酸氢盐转化(Bisulfite conversion)、用甲基化敏感的限制性内切酶(如HpaⅡ、MspⅠ等)酶切和甲基化特异性PCR(Methylation specific PCR, MSP)等方法，评估基因组中的特定甲基化位点[ ]。
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