文献综述
文 献 综 述1.1研究背景随着各种基因组计划的实现,生物信息学迅猛发展,产生了大量的生物学数据。
序列数量几乎每 2.5 年翻一番，暗物质，即没有精确和验证功能可用的序列，正在爆炸式增长；然而，暗物质提供了生物学的巨大资源，因为它包含未被发现的新酶和代谢途径。
目前，人们正面临着从基因组大数据中挖掘各种生物资源的新任务，如筛查特定功能的酶、挖掘合成新天然产物的基因簇等。
在海量测序结果面前，数据深度挖掘和解读方面存在的严峻挑战日益明显。
如何在基因大数据时代利用好这些数据资源，已经成为生物科研新时代的重要课题。
[1]数据库中大约50%的蛋白质有不正确、不确定或未知的功能注释。
UniProt知识库（UniProtKB）由UniProtKB/SwissProt和UniProtKB/TrEMBL两部分组成。
UniProtKB/SwissProt中的注释是手动策划的；UniProtKB/TrEMBL中的功能注释是基于最近同系物的功能计算分配的。
原则上，精心策划的注释可以扩展到直系同源词；然而，函数之间的序列边界是未知的，因此基于同源性的函数赋值方法是有风险的。
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