乳酸杆菌的基因组特征分析文献综述

开题报告内容：（包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述，不少于2000字）

研究的问题：就当下研究现状来看，乳酸杆菌作用的研究大多数为表象功能的观察，以及乳酸菌基因组测序集中在研究一株具有特定功能菌株的基因组结构、组成、生物学功能及代谢途径等。 而对于具体基因的功能深入研究较少。

采用的研究手段：本课题采用生物信息学方法，从基因组层次研究乳酸杆菌与其他细菌的差异，通过参考HMP数据库，查询注释信息，对同一属中不同菌种或同一菌种中不同株进行比较基因组学研究， 进而解析乳酸菌的基因功能，代谢网络调控以及群体遗传与物种分化过程。

1.研究背景

乳酸杆菌属乳酸杆菌科，因发酵糖产生大量乳酸而命名，酸奶中就有此菌。它作为一种生活在机体内益于宿主健康的微生物，维护人体健康和调节免疫功能的作用已被广泛认可。而乳酸杆菌在一定数量下，能够对宿主健康产生有益作用^[1]。

在中国知网期刊数据库网站以 “乳酸杆菌”作为主题词检索全部期刊文献，可以获得中文文献有6094篇。在 pubmed数据库在线分析网站以“lactobacillus”作为主题词检索则可以获得外文文献35703篇^[2]。中国知网中对于乳酸杆菌的研究最早可以追溯至1965年，早期的相关文献非常少，大多是关于研究乳酸杆菌的生物学特征，及相关的分离与培养方法。直到1995年，发文数量逐渐开始增加，也反映出研究者们对乳酸杆菌的关注度增加。但到近两年里，开始呈现下降的趋势，可能是肠道菌群的作用越来越不可忽视，研究者们更多地投入到菌群的研究当中。

对pubmed中的文献进行统计，发现早期乳杆菌的分离纯化研究最多，关于代谢和遗传学研究也较多，从1997年开始，乳酸杆菌的治疗用途的发现逐渐增加。

在对于乳酸杆菌进行研究的地区、国内外机构以及期刊排名前五位见表1。而在中文期刊里，中国微生态学杂质对于乳酸杆菌的文献报道最多，发文数量位列前3位的研究机构分别为中国江南大学、中国农业大学和东北农业大学，而发文数量较多的学者大多都来自于内蒙古农业大学。

图1