开题报告内容：1.绪论1.1目的新型冠状病毒包括四种结构蛋白，其中：刺突蛋白（Spike,S）通过受体结合域（receptor binding domain,RBD）与宿主细胞血管紧张素转化酶2（angiotensin-converting enzyme 2,ACE2）受体结合，帮助病毒侵入宿主细胞；包膜蛋白（Envelope,E）参与病毒的组装、释放和发病机制；核衣壳蛋白（Nucleocapsid,N）以不同形式结合病毒基因组RNA，并在不同的冠状病毒间较为保守。
鉴于三者在新型冠状病毒的检测与疫苗研发中的重要作用，本实验选取E蛋白、N蛋白N端片段和S蛋白的RBD片段为研究对象，通过生物信息学对其结构、亲水性、跨膜域以及抗原性等进行综合分析。
1.1.2 刺突蛋白（Spike,S）刺突蛋白(spike pro-tein,S蛋白)是新型冠状病毒感染细胞的关键蛋白,在病毒的宿主嗜性和毒力等方面发挥重要作用.S蛋白三聚体结构自发呈现封闭和开放的构象状态对于受体的结合及膜融合构象变化的启动至关重要,其独特的弗林蛋白酶识别位点可能是导致高传染性的重要因素1.1.3 包膜蛋白（Envelope,E）是新冠病毒进行组装的关键蛋白，在病毒的宿主融合过程与侵染细胞过程中有关键地位，发挥着重要作用。
1.1.4 核衣壳蛋白（Nucleocapsid,N）N蛋白与病毒基因组ＲＮＡ相互缠绕形成病毒核衣壳，在病毒ＲＮＡ的合成过程中发挥着重要的作用，序列较保守，毒株间一般差异较少，可用于快速免疫诊断检测试剂的开发。
同时，Ｎ蛋白在病毒的结构蛋白中含量非常丰富，感染早期机体就能产生抗Ｎ蛋白的高水平抗体。
2实验部分2.1材料与方法 （第一步）新型冠状病毒E、N、S蛋白的氨基酸序列由NCBI查询得到，GenBank登录号分别为：E蛋白（QKM76908.1），N蛋白的N端片段（QKM76914.1），S蛋白的RBD片段（PDB: 6M0J_E）。
（1）利用Protpara在线工具对三种蛋白的一级结构进行分析，获得三种蛋白相应的基本理化性质。
（2）PredictProtein在线工具对三种蛋白的二级结构进行分析，获得三种蛋白相应肽链的排布情况。
2.1.2 蛋白信号肽与跨膜域预测（1）利用SignalIP-5.0在线工具分析三种蛋白有无信号肽。
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