生物催化剂的改造文献综述

 2023-01-31 10:01

一、 拟研究的问题:

2-脱氧-D-核糖-5-磷酸醛缩酶(2-deoxy-D-ribose 5-phosphate aldolase,DERA)是目前发现的唯一一种乙醛依赖型醛缩酶。在生物体内,DERA可逆地催化其天然底物乙醛和D-甘油醛-3-磷酸发生醛缩反应,生成2-脱氧-D-核糖-5-磷酸,参与多种微生物的DNA代谢途径。该酶属于Ⅰ类醛缩酶,反应不需要辅因子,以一个保守的赖氨酸作为活性位点。DERA具有较宽的底物谱,除乙醛外,还能够以丙醛、丙酮、氟代丙酮作供体。

DERA是已知唯一可以催化醛类物质之间的交叉羟醛缩合的醛缩酶,这使其备受关注。因为供体受体均为醛,以乙醛作供体的缩合产物同时可作为进一步缩合的受体底物,从而能在醛缩底物上引入多个手性中心,二次缩合的产物可生成稳定的半缩醛,阻止后续反应的发生。二次缩合获得的手性产物可以用于合成他汀类药物的手性侧链前体,这种生物催化工艺以廉价的、非手性的材料为起始底物,极大地降低了生产成本,并具有很好的环境友好性,具有广阔的应用前景。

本课题拟利用定点突变和体外分子(酶)定向进化等方法,针对DERA进行分子修饰,表达后筛选优化,提高其催化活性,使其适用于工业化生产。

二、 研究目标:

1、起始突变株的筛选

根据专利文献报道的基因序列,并选择合适的表达载体,人工合成DERA的表达序列并转化到表达宿主E.coli(BL21)内,实现高效重组表达。然后利用DERA的天然底物以及本课题的目标底物(CAS:65564-05-8)进行酶反应,筛选出具比活度最高的酶作为起始突变株

2、DERA的改造

利用定向进化及理性设计等方法,对DERA起始突变株进行改造。具体采用易错PCR、DNA改组以及瞬时模板随机嵌合等技术,通过改变DNA扩增条件,向目的基因中引入随机突变点或产生DNA片段重组,以达到对DERA的基因进行体外定向进化的目的。或者参考已有文献资料,在特定的位点产生饱和突变,筛选酶活特性最优的突变株。

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